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首頁 > 培訓課程 > 學術/科研培訓 > 不做實驗不查病史,臨床工作者如何 利用TCGA及SEER等癌癥公共數據庫發表 SCI 論文會議 更新時間:2020-10-10T14:32:36

不做實驗不查病史,臨床工作者如何 利用TCGA及SEER等癌癥公共數據庫發表 SCI 論文會議
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不做實驗不查病史,臨床工作者如何 利用TCGA及SEER等癌癥公共數據庫發表 SCI 論文會議 已截止報名

課程時間: 2020-11-28 09:00至 2020-11-29 18:00結束

課程地點: 線上活動 

會議規模:40人

主辦單位: 洛陽慕臻生物科技有限責任公司

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        會議通知

        會議內容 主辦方介紹


        不做實驗不查病史,臨床工作者如何 利用TCGA及SEER等癌癥公共數據庫發表 SCI 論文會議

        不做實驗不查病史,臨床工作者如何 利用TCGA及SEER等癌癥公共數據庫發表 SCI 論文會議宣傳圖

        會議簡介:

        手頭沒有資源,臨床醫生如何挖得科研的第一桶金?身處大數據時代,對于從事腫瘤研究的臨床醫生或科研人員,有沒有一種可以既不做實驗又不查病史,直接調用公共數據撰寫發表?SCI?論文的方法呢?TCGA?和?SEER?等癌癥公共數據庫即提供了這樣一種可能。TCGA?和?SEER?分別側重于組學數據和臨床數據,各有優勢。TCGA(癌癥基因組圖譜)數據庫是一個多組學的數據庫,包括常見癌癥的基因組、轉錄組、蛋白組、表觀遺傳組數據和與其關聯的臨床數據,為挖掘有意義的組學變化和發現腫瘤發生、發展、轉移等生物學機制提供了海量數據。美國的?SEER(癌癥監測、流行病學和結果)數據庫則是典型的臨床醫學數據庫,是北美最具代表性的大型腫瘤登記注冊數據庫之一,收集了各個癌種的海量臨床病理信息和預后數據,并向全世界免費開放,為臨床醫師的循證實踐及臨床研究提供了寶貴的第一手資料。據不完全統計,全世界基于?TCGA?和?SEER?數據挖掘產生的文章已經超過?2000?篇,其中不乏最頂尖的學術期刊文章(如?JAMA、新英格蘭、Nature、Cell?等),這一數目還在不斷增長中。以往的?TCGA?課程往往側重于?R?語言程序的講解,不少學員反應難以掌握。本課程立足應用和實戰,宗旨是“臨床醫生聽得懂、學得會,科研人員亦有收獲”。本課程將從臨床應用視角介紹癌癥公共數據庫?TCGA、SEER?的基本情況、數據庫結構、數據獲取方式及基本統計方法等,深度解析近年講課人發表的基于?TCGA?和?SEER?數據挖掘的經典案例,重點對癌癥公共數據庫的數據挖掘和課題設計進行討論,最后也將探討在此基礎上的基金申請、SCI?論文撰寫策略。


        時間地點:2020/11/28--11/29?線上直播


        學習目標:

        本次培訓提供了一次系統掌握?TCGA?和?SEER?等癌癥公共數據庫數據結構、挖掘方法及分析流程的機會,目的在于助力有志于利用這些公共數據庫的臨床醫生以及轉化研究的科研人員,幫助研究者去更好地挖掘利用這些免費的公共數據。本次培訓不側重于深入的生物信息學分析講授,擬解決的問題包括:1、如何基于?TCGA?及?SEER?等癌癥公共數據庫設計課題;2、TCGA?及?SEER?數據庫的數據獲取;3、獲取數據后如何分析;4、如何在此基礎上撰寫?SCI?論文及申請科研基金。


        授課方式:

        1、上機操作,2、專題小組研討與案例講解分析結合,3、課程講座;(主題明確,針對性強。專題小組研討與案例講解分析結合。)


        參會對象:

        主要面向從事腫瘤研究的臨床醫生、轉化研究科研人員、在校研究生以及廣大臨床腫瘤研究領域的科研工作者。




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        會議日程 (最終日程以會議現場為準)


        課程大綱:

        第一天上午:TCGA?數據庫入門

        1.?什么是?TCGA?TCGA?數據庫基本概念介紹(數據類型、數據級別及barcode)

        2.?如何獲取?TCGA?數據?(實戰)TCGA?數據獲取方法(下載單樣本數據與匯總數據表)

        3.?如何利用?TCGA?數據撰寫論文?結合講者發文案例,進行基于?TCGA?數據庫發表文章的深度解析

        第一天下午:SEER?數據庫入門

        1.?什么是?SEER??SEER?數據庫基本概念介紹(數據構成、變量類型)

        2.?如何獲取?SEER?數據?(實戰)?SEER?軟件安裝、權限申請及數據獲取

        3.?如何利用?SEER?數據撰寫論文?結合講者發文案例,進行基于?SEER?數據庫發表文章的深度解析

        第二天上午:TCGA?和?SEER?數據深度挖掘

        1.?如何深度挖掘公共數據庫并進行臨床轉化課題設計沒有資源、資源有限以及資源豐富的三種情況下如何開展轉化研究

        2.?實戰:利用?Excel、SPSS、Graphpad?進行基于?TCGA?數據挖掘

        a)?如何實現?TCGA?原始數據的整理

        b)?如何使用?Excel?進行不同數據表的拼接

        c)?如何在整理數據表基礎上進行統計分析和作圖

        3.?實戰:利用?R?程序進行?TCGA?和SEER?數據挖掘

        a)?R?語言基礎知識

        b)?如何利用?R?程序實現單個樣本文件的拼接和計算

        c)?如何利用?R?程序進行圖形制作

        d)?如何利用?R?程序制作?nomogram

        第二天下午:論文標書撰寫與實用統計方法

        1.?SCI?論文撰寫技巧

        a)?SCI?論文框架與寫作思路

        b)?SCI?論文圖表制作技巧

        c)?如何撰寫?Cover?Letter?并在修回時與審稿人有效溝通

        2.?實用科研統計方法實戰以?GraphPad?和?SPSS?軟件使用為例,介紹:

        a)?直方圖、散點圖、折線圖、生存曲線、熱圖等常用統計圖形制作

        b)?t?檢驗、ANOVA、卡方檢驗、單因素及多因素生存分析

        3.?醫學基金標書撰寫技巧?結合國自然面上項目成功中標實例和評審經驗

        4.?現場答疑

        對學員提出的問題進行詳細解答并對?2?天課程內容進行補充延申

        備注:自備?WINDOWS?操作系統筆記本電腦,需要安裝?SPSS、R/R?studio、GraphPad?Prism、SEER*Stat?以

        及?Office?Excel?2007?以上版本等軟件。


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        會議嘉賓 (最終出席嘉賓以會議現場為準)


        主講專家:

        本次主講老師是來自國內知名三甲醫院腫瘤專業的臨床醫生和科研工作者,有著豐富的臨床和轉化研究經驗。以一作和通訊作者發表?SCI?論文?26?篇,10?分以上論文?8?篇,累計影響因子?266。其中成功用TCGA、SEER?數據庫發表十幾篇?SCI,平均影響因子?4.6?分一篇。目前主持國家自然科學基金面上項目及多項省部級人才項目,擔任一本?SCI?雜志的?Section?editor,以及多本影響因子?5?分以上?SCI?雜志審稿人。

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        參會指南

        會議門票


        參會費用:

        2800?元/人(含會議費、會務費、會議注冊費、資料費等)


        優惠政策:

        1:在讀學生憑有效在讀證明或學生證減免?200?元

        2:11?月?1?日前報名并繳費的學員減免?200?元

        3:3?人團報,每人減免?200?元

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        溫馨提示
        酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
        退款規則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

        還有若干場即將舉行的 TCGA及SEER大會

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        會議地點

        部分參會單位

        主辦方沒有公開參會單位
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